Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCX3AQ9NNX9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCX3AQ9NNX9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms