Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms