Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabgef1Q9JM13 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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