Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmx1aQ9JKU8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms