Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Riox1Q9JJF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms