Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpf2Q9JJ80 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms