Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LratQ9JI60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms