Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREBQ9HCU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms