Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCBP2Q9H190 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCBP2Q9H190 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms