Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCOLN1Q9GZU1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCOLN1Q9GZU1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms