Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr6Q9EPW9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr6Q9EPW9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms