Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx6Q9DBY5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx6Q9DBY5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx6Q9DBY5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms