Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3bQ9DA80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms