Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem239Q9DA47 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms