Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgf29Q9DA08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgf29Q9DA08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms