Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl4Q9D8E6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms