Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alg13Q9D8C3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alg13Q9D8C3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms