Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cyp2c55Q9D816 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp2c55Q9D816 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2c55Q9D816 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms