Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan17Q9D7W4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms