Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl40Q9D783 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms