Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3a3Q9D554 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms