Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhd1Q9D4J1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd1Q9D4J1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms