Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Katnal2Q9D3R6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnal2Q9D3R6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms