Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430402E10RikQ9D3N5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430402E10RikQ9D3N5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms