Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef12Q9D2F1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 783.3 ms