Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D1F3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D1F3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D1F3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D1F3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D1F3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D1F3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9D1F3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D1F3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D1F3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D1F3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D1F3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D1F3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D1F3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms