Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exo5Q9CXP9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exo5Q9CXP9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exo5Q9CXP9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exo5Q9CXP9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exo5Q9CXP9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exo5Q9CXP9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exo5Q9CXP9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exo5Q9CXP9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo5Q9CXP9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms