Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prkrip1Q9CWV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prkrip1Q9CWV6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms