Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddx28Q9CWT6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddx28Q9CWT6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddx28Q9CWT6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddx28Q9CWT6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddx28Q9CWT6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddx28Q9CWT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddx28Q9CWT6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms