Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ly6kQ9CWP4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms