Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms