Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc43Q9CR29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms