Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Use1Q9CQ56 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Use1Q9CQ56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Use1Q9CQ56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Use1Q9CQ56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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Use1Q9CQ56 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Use1Q9CQ56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Use1Q9CQ56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Use1Q9CQ56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Use1Q9CQ56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Use1Q9CQ56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Use1Q9CQ56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Use1Q9CQ56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Use1Q9CQ56 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Use1Q9CQ56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Use1Q9CQ56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Use1Q9CQ56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms