Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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