Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PCGF6Q9BYE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCGF6Q9BYE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms