Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC3Q9BY71 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms