Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SYCP2Q9BX26 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SYCP2Q9BX26 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms