Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC94Q9BW85 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC94Q9BW85 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms