Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMED9Q9BVK6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms