Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF4Q9BUZ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms