Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms