Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF1Q9BQI6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms