Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rnf17Q99MV7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rnf17Q99MV7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rnf17Q99MV7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rnf17Q99MV7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rnf17Q99MV7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rnf17Q99MV7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rnf17Q99MV7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rnf17Q99MV7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rnf17Q99MV7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rnf17Q99MV7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rnf17Q99MV7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms