Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp1b4Q99ME6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp1b4Q99ME6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms