Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd3Q99LY2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms