Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RtcbQ99LF4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms