Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TriobpQ99KW3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms