Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lactb2Q99KR3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms