Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdxdc1Q99K01 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms