Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL1Q99961 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms